There's no national level, in order to really promote international co-operation and avoid creating any physical or mental borders AEGEE does not recognize any national level or national administration in its unique organizational structure.

Local level – where people from the 241 autonomic AEGEE locals directly implement AEGEE aims in a way that serves best the needs of their local community.
European level – which gives the great common frame and direction for all local activities and provides a platform for international co-operation in multicultural teams.

Antenna è il nome di ogni sede locale. Un antenna organizza almeno un Evento Europeo l’anno, e varie attività locali. le cui attività sono gestite e coordinate da un board di 6-7 membri. Le Antennae espletano le loro attività a livello cittadino e molto spesso si appoggiano ad una struttura universitaria, considerato anche il fatto che la maggior parte dei membri di AEGEE sono studenti universitari. Attualmente ci sono circa 260 antennae in Aegee Europe, da Mosca a Madrid, da Istanbul a Stoccolma.
        
Comité Directeur (CD), con sede a Bruxelles. Esso coordina le attività delle varie sedi locali, gestisce le problematiche comuni e rappresenta l'associazione nelle istituzioni sovranazionali. È composto di 9 membri che vengono eletti semestralmente in occasione delle assemblee generali dell'associazione (Agorà). È composto da Presidente, Direttore Finanziario, Segretario Generale, Direttore delle Pubbliche Relazioni, Direttore per lo sviluppo del Network, Direttore delle Relazioni Esterne, Direttore per le Istituzioni Europee, Direttore dei Progetti e Direttore delle Risorse Umane. Sono eletti durante le Agora.

Working Groups (WG) sono la spina dorsale tematica di AEGEE. Sono gruppi internazionali i cui componenti organizzano eventi basati su tematiche specifiche, come politiche, minoranze europee o argomenti ambientali. Per maggiori notizie clicca qui.

Le Commissioni sono un organismo di  supporto e controllo per il direttivo europeo (CD). Sono: Audit Commission, Members Commission, Juridical Commission e la Network Commission.  Per maggiori notizie clicca qui.

The Project Teams coordinano il lavoro dei progetti in tutta Europa. Questi progetti possono essere conferenzesu argomenti specifici, giornate tematiche e ogni altro tipo di attività. Questi team sono composti da studenti di diverse nazionalità eletti durante l’Agora. Per maggiori notizie clicca qui.

I Liaison Officers (LO – ufficiali di collegamento) rappresentano AEGEE-Europe presso una istituzione o organizzazione ( per esempio UNESCO o la European Youth Foundation). Il CD decide presso quale istituzione un LO deve essere  indirizzato e sceglie anche le persone, dopo una trasparente selezione aperta a tutto il network (che avviene sulla mailing list principale). In ogni caso ogni decisione deve essere ratificata dall’Agora.